NVIDIA、Google DeepMind、および欧州分子生物学研究所の欧州バイオインフォマティクス研究所（EMBL-EBI）は、2,800種類以上のウイルスのタンパク質複合体における予測3D構造を公開しました。このデータセットは、現在AlphaFold Databaseを通じて科学コミュニティに提供されています。
提携エヌビディアGoogle DeepMind欧州バイオインフォマティクス研究所AlphaFold DatabaseAlphaFold2
NVIDIAとDeepMindが2,800種以上のウイルスに関する3Dタンパク質複合体構造を公開
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予測された構造は、NVIDIA BioNeMo Inference Runtimeによって最適化されたAlphaFold2を使用して生成されました。これにより、チームは数千ものウイルスプロテオームにわたる推論をスケールアップさせることができました。このプロセスにより、相互作用するタンパク質のグループである「タンパク質複合体」を、X線結晶構造解析のような従来の実験手法よりもはるかに速い規模とスピードで予測することが可能になります。
データベースに追加されたタンパク質相互作用の約30%は科学的に全く新しいものであり、これまでにProtein Data Bankに記録されていない形状を示しています。今回の公開は、科学者がウイルスのメカニズムをより深く理解し、将来の発生に対するワクチンや抗ウイルス薬の開発を加速させるための基礎的な生物学的データを提供することを目的としています。
データセットに加えて、NVIDIAはBioNeMo Structure Prediction Pipelineを公開しました。これはGPUによって加速されたワークフローであり、研究者が独自のターゲットに対してタンパク質配列から3D構造を予測することを可能にします。
出典
- How Open Science Can Help Researchers Prepare for the Next Pandemic （NVIDIA Generative AI, 2026-09-24）
- AlphaFold Database